「在逐漸沉沒的世界，我找到了你。」                                                                      　　在近未來，不明原因的海平面上升導致大面積地表被海水淹沒。                                                                      　　幼時因意外事故失去了一條腿的少年斑鳩夏生厭倦了城市生活，遷居到了海邊的鄉村小鎮。                                                                      　　他無親無故，留給他的只有曾屬於海洋地質學家的祖母的船和潛水艇，以及債款。                                                                      　　夏生爲了取回自己“失去的未來”，潛入大海尋找據說沉睡着祖母遺產的海底倉庫。                                                                      　　他在那裏找到的，是沉睡在棺材狀裝置中的神祕少女——亞託莉。                                                                      　　她是幾乎與人類無異的，精巧且感情豐富的機器人。                                                                      　　從海底被打撈上來的亞託莉說道。                                                                      　　「我想完成主人留下的最後一道命令。在那之前，我來做夏生的腳！」                                                                      　　在逐漸沉入海中的安寧小鎮，少年與機器人少女難以忘懷的夏天開始了——